顾毓琇纪念馆是在顾毓琇故居的基础上改建而成的。

2004年10月，中共中央办公厅批示，同意将顾毓琇故居改建为顾毓琇纪念馆。顾毓琇纪念馆由江泽民题写馆名，该馆是江苏省自周恩来纪念馆之后第二座被正式批准建立的名人纪念馆。